تجزیه و تحلیل سوگیری استفاده از کدون ژنوم کلروپلاست سیستانچ

خلاصه:

هدف برای روشن شدن سوگیری استفاده از کدون و عوامل موثر بر ژنوم کلروپلاست در چهار گیاه دارویی گونه های Cistanche. MethodsThe کدون استفاده از پارامترهای سوگیری ازCistanche deserticola, سیستانچسالسا وسیستانچتوبولوزاتوسط CUSP، CodonW 1.4.2، SPSS و Microsoft Excel مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.

نتایج ژنوم کلروپلاست چهار گونه سیستانچ دارای الگوهای استفاده از کدون مشابهی بود، با پایه سوم کدون ها که همگی به A/T ختم می شوند و تمایل بیشتری به استفاده از پایه های A/T دارند.

مقادیر ENC (تعداد موثر کدون) چهار گونه همه بالاتر از 35 بود، که نشان می‌دهد ترجیح کدون ژن‌های کلروپلاست در گونه‌های Cistanche. ضعیف است. نتایج نمودار خنثی، ENC-plot، PR{2}}طرح سوگیری و تجزیه و تحلیل متناظر نشان داد که انتخاب طبیعی عامل اصلی مؤثر بر سوگیری استفاده از کدون ژنوم کلروپلاست در گونه‌های Cistanche بود. مقادیر RSCU (استفاده از کدون مترادف نسبی) برای شناسایی چهار کدون بهینه مشترک توسط چهار گونه گونه Cistanche استفاده شد.

نتیجه‌گیری در این مطالعه، ما سوگیری استفاده از کدون ژنوم کلروپلاست چهار گونه را تجزیه و تحلیل کردیم.Cistanche tubulosa. و فاکتورهای تأثیرگذار مؤثر بر بایاس کدون را نشان داد، که مبنای نظری مربوطه را برای مطالعه تکامل سیستماتیک، سازگاری محیطی و بهبود نژاد فراهم کرد.سیستانچدر سطح مولکولی

برای دریافت عصاره Cistanche Tubulosa اینجا را کلیک کنید

بیشتر بخواهید:

ایمیل:wallence.suen@wecistanche.com Whatsapp plus 86 15292862950

سیستانچ هافمن & Link یک گیاه انگلی چند ساله از خانواده Orobanchaceae است که عمدتاً در اروپا و آسیا پراکنده شده و دارای چهار گونه است.سیستانچدر مغولستان داخلی، نینگشیا، گانسو، چینگهای و سین کیانگ [1].

در میان آنها،Cistanche deserticola Maدارای بالاترین ارزش دارویی است و به دلیل اینکه عمدتاً در مناطق کویری رشد می کند به "جنسینگ صحرایی" معروف است. با این حال، گیاهان دارویی از جنس Cistanche با سردرگمی در طبقه بندی گیاهان [2] و سردرگمی در استفاده از گونه های تجاری موجود [3] مواجه هستند. کلروپلاست ها محل فتوسنتز در اکثر گیاهان سبز هستند، در فعالیت های متابولیکی تکاملی و ثانویه نقش دارند [4] و بیان ژن را بین اندامک ها و ژنوم هسته ای هماهنگ می کنند [5]. کلروپلاست ها دارای ژنوم ارثی مستقل هستند و به طور گسترده در مطالعاتی مانند تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک گیاهی، شناسایی گونه ها و بیان تنوع ژنتیکی استفاده می شوند. در سال‌های اخیر، با بلوغ فناوری توالی‌یابی با توان بالای ژنوم کلروپلاست، چندین گیاه از جنس Cistanche، Cistanche salina C. salsa (CA Mey.) G. Beck، Cistanche salsa C. sinensis G. Beck، و Cistanche tubulosa Wight تحت مطالعات توالی یابی کلروپلاست و فیلوژنی و ژنتیکی آنها قرار گرفته اند، اما هیچ مطالعه ای در مورد ترجیح کدون ژنوم کلروپلاست گونه های Cistanche انجام نشده است. گزارش شده اند.

کدون که به عنوان کد ژنتیکی نیز شناخته می شود، پل بین اسیدهای نوکلئیک و پروتئین ها است. پل بین اسیدهای نوکلئیک و پروتئین ها است و یک شناسایی و انتقال مهم اطلاعات ژنتیکی است. ].

با توجه به تفاوت در فرآیند ترجمه پروتئین در بین گونه ها، تمایل به استفاده از یک یا فرآیند ترجمه گونه های مختلف وجود دارد، آنها تمایل به استفاده از یک یا چند کدون مترادف خاص دارند این پدیده سوگیری استفاده از کدون (CUB) نامیده می شود [9]. این پدیده سوگیری استفاده از کدون (CUB) [9] نامیده می شود و ترجیح کدون تأثیر قابل توجهی بر ترجمه mRNA، رونویسی DNA، ساختار پروتئین، بیان و بیان دارد. ترجیح کدون نقش مهمی در ترجمه mRNA، رونویسی DNA، ساختار پروتئین، بیان، عملکرد و تاخوردگی هم‌ترجمه‌ای و سایر فرآیندهای متابولیک سلولی دارد. ترجیح کدون نقش مهمی در فرآیندهای متابولیک سلولی مانند ترجمه mRNA، رونویسی DNA، ساختار پروتئین، بیان، عملکرد و تاخوردگی هم‌ترجمه ایفا می‌کند [10]. Shi Yanshuo و همکاران [11] ترجیح کدون چهار گونه Panax ginseng را با تجزیه و تحلیل ترجیح ژنوم کلروپلاست چهار Panax Linn تجزیه و تحلیل کردند. با تجزیه و تحلیل ترجیح کدون ژنوم کلروپلاست چهار Panax Linn. گیاهان و استنباط کردند که گیاهان در یک جنس نزدیکتر به یکدیگر هستند. سونگ یون و همکاران [12] نشان دادند که ژن ICE1 را می توان بر اساس ترجیح کدون بهینه کرد و آن را در برابر استرس دمای پایین مقاوم تر کرد.

سونگ یون و همکاران [12] نشان دادند که ژن ICE1 می تواند برای بیان تحت تنش دمای پایین بر اساس ترجیح کدون بهینه شود. Li Xianhuang و همکاران [13] دریافتند که Li Xianhuang و همکاران [13] دریافتند که ترجیح کدون می تواند منعکس کننده روابط تکاملی بین گونه ها باشد. Zhang Jun Yan Li و همکاران [13] دریافتند که ترجیح کدون منعکس کننده رابطه تکاملی بین گونه ها است. جون یان ژانگ و همکاران [14] نشان دادند که جهش و انتخاب طبیعی با هم بر بیان Swertia bimaculate (L.) تأثیر می‌گذارند. ژانگ جونیان و همکاران [14] نشان دادند که جهش و انتخاب طبیعی با یکدیگر ترکیب شدند تا بر رابطه تکاملی Swertia bimaculate (Sieb. et Zucc.) Hook تأثیر بگذارند. f. et تامز. ترجیح کدون ژنوم کلروپلاست CB برای swertia bimaculate (Sieb. et Zucc.) Hook. f. et تامز. مطالعه ترجیحات کدون ژنومی کلروپلاست در ژنوم کلروپلاست گیاهی به منظور ارائه مبنایی برای اهلی کردن سوئد انجام شد. بنابراین، مطالعه الگوهای استفاده از کدون ژنوم های کلروپلاست گیاهی می تواند زمینه ای برای اهلی کردن سوئد فراهم کند. بنابراین، مطالعه الگوهای استفاده از کدون ژنوم‌های کلروپلاست می‌تواند به بهبود کارایی مکانیسم‌های مولکولی ساخت ناقل بیان ژن برای سازگاری با محیط و بهبود واریته‌های گیاهی کمک کند. بنابراین، مطالعه الگوهای استفاده از کدون ژنوم‌های کلروپلاست گیاهی می‌تواند پشتیبانی داده‌ها را برای بهبود کارایی ساخت وکتور بیان ژن، کاوش در روابط تکاملی گونه‌ها، درک مکانیسم‌های مولکولی سازگاری با محیط، و بهبود گونه‌های گیاهی فراهم کند [15].