چکیده:با استفاده ازکوارتریانگل دو گیاه میزبان (Haloxylon Ammodendron و Atriplex Canescens) به عنوان مواد آزمایشی ، این مطالعه میزان پلی ساکارید را در C. eserticola از میزبان های مختلف با استفاده از روش اسید فنل-سولفوریک تعیین کرد. توالی رونویسی و تجزیه و تحلیل هالوکسیلون-کیستان وانجمن های Atriplex-Cistancheبا استفاده از سکوی توالی Illumina Novaseq 6000 انجام شد. این تحقیق بر بررسی تفاوت های رونویسی در C. eserticola از میزبان های مختلف ، غربالگری ژنهای آنزیمی کلیدی درگیر در متابولیسم پلی ساکارید و اعتبار ژن های انتخاب شده از طریق تأیید QRT-PCR متمرکز شده است. این مطالعه با هدف ارائه یک مبنای نظری برای کاوش در گیاهان میزبان جدید و بهبود ژنتیکی C. eserticola انجام شده است. نتیجه نشان داد که محتوای پلی ساکارید موجود در Atriplex Quadriptera-C.Deserticola نسبت به آنچه در هالوکیلون Ammodendron-C وجود دارد برتر بود. بیابانی از طریق تجزیه و تحلیل تطبیقی ​​رونوشت ، 14089 ژن متفاوت بیان شده (DEG) از ساقه های گوشتی چهارگوشه Atriplex بررسی شدند. بیابانی و هالوکیلون Ammodendron-C. بیابانی نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل غنی سازی KEGG نشان داد که این DEG ها در مسیرهای مربوط به متابولیسم کربوهیدرات ، متابولیسم گالاکتوز ، متابولیسم اسید آمینه و متابولیسم اسید چرب غنی شده اند. علاوه بر این ، در مجموع 26 درجه از چهار مسیر مربوط به متابولیسم پلی ساکارید به دست آمد ، که در میان آنها سطح بیان ژن فروکتوزیداز و ژن -galactosidase در مهمات هالوکیلون مهم. بیابانی به طور قابل توجهی بالاتر از آنهایی که در چهارگوش Atriplex بودند ، بالاتر بود. بیابانی سطح بیان ژن udp- گلوکز دهیدروژناز و مانوز {12}}} ژن ترانسفراز گانیلات فسفات در quadriptera-c atriplex. بیابانی به طور قابل توجهی بالاتر از آنهایی که در هالوکسییلون مهم بود ، بالاتر بود. بیابانی ، که ممکن است ژنهای اصلی آنزیم برای تنظیم تفاوت متابولیسم پلی ساکارید در C. eserticola باشد.

کلمات کلیدی کوارتری; توالی رونویسی؛ میزبان ؛ تفاوت متابولیسم پلی ساکارید

کوارتری

 

Cistanche Deserticola YC MA، در درجه اول توزیع شده درگانسو ، سین کیانگ ، نینگکسیا و مغولستان داخلی، یک گیاه دارویی سنتی چینی است که اخیراً در آن گنجانده شده است"دارویی و غذایی همولوگ"کاتالوگ این مزایای بهداشتی مختلفی دارد ، مانندتنگی یانگ کلیه ، ذات تغذیه کننده و خون و ترویج حرکات روده، ساختن آن به طور گسترده ای درپزشکی ، مراقبت های بهداشتی و صنایع غذایی[1] به دلیل آنماهیت هتروتروفیک, کوارتریگیاهان میزبان مختلف را با آن انگل می کندهالکسیلون آمودندرونو تازه معرفی شدهدرختچهقوطی های Atriplex(Pursh) Nutt.میزبان اصلی آن است.

پلی ساکاریدها مواد اصلی فعال در ارزیابی هستندکوارتریکیفیت در شرایط میزبان مختلف ،تجمع و ترکیب متابولیکازسستنسپلی ساکاریدها به طور قابل توجهی متفاوت هستند [2]. تحقیقات پزشکی نشان داده است کهسستنسپلی ساکاریدهاآنتی اکسیدان ، محافظت کننده عصبی ، تنظیم ایمنی و تقویت کننده حافظهاثرات دارویی ، به طور موثری کاهش می یابدبیماری آلزایمر ، بیماری پارکینسون و کمبود طحال ناشی از افسردگی کبد[3] با پیشرفت در مدرنتکنیک های استخراج و فن آوری های تجزیه و تحلیل چند طیف،محتوا ، ترکیب و خصوصیات ساختاریازسستنسپلی ساکاریدها به تدریج روشن می شوند و برنامه های خود را گسترش می دهند.

از نظرتحقیقات زیست شناسی مولکولیدرسستنسگونه ها ، مطالعات توالی رونویسی عمدتاً روی آن متمرکز شده اندتوبولوزاوتhaloxylon-سستنسسیستم های پیچیدهبه عنوان مثال ،هو و همکاران.[4] انجام شدتوالی رونویسی کامل و پروفایل بیان ژنازتوبولوزابا استفاده ازPACBIO و BGISEQ -500 RNA-SEQ Technologies، شناسایی237،772 رونوشت منحصر به فردو غربالگری ژنهای آنزیم کلیدی درگیر دربیوسنتز گلیکوزید فنیل اتنوئیدبشر به همین ترتیب ،فنگ و همکاران.[5]تجزیه و تحلیل رونویسی و متابولیکاز Haustoria و بافت های مجاورریشه های هالوکیلون وسستنسساقه های گوشتی، آشکار کردن نقش میزبان در تجمعسستنسمتابولیت ها مطالعه آنها تأکید کرد کهگیاه میزبان نه تنها بر عملکرد تأثیر می گذاردسستنسبلکه کیفیت آن نیز هستبشر با این حال ، تحقیقات در موردسستنسانگل گیاهان مختلف میزبان محدود است.

قوطی های Atriplex, a گیاه ریشه دار و بسیار مقاوم به استرس، با سنتی متفاوت استمیزبان Haloxylonو ازفلات نیمه خشک ایالات متحده مرکزیبشر در سالهای اخیر ، آن را به عنوان یک معرفی و تبلیغ کرده استمیزبان جدید برایکوارتریکشتدرشمال غربی چین. چینگ و همکاران.[6] تجزیه و تحلیل و مقایسهتجمع پلی ساکارید ازسستنسانگل Haloxylon و Atriplex canescensدر همان منطقه تولید ، یافتنتفاوت معنی داری در محتوای پلی ساکاریدبین دو شرط میزبان.

بنابراین ، این مطالعه با هدفتوالی ساقه های گوشتیکوارتریانگل Haloxylon و Atriplex canescens، تجزیه و تحلیلبیان دیفرانسیل ژنهای آنزیم کلیدی درگیر در بیوسنتز پلی ساکاریدبشر یافته ها یکبنیاد نظری برای تحقیقات بیشتر در موردسستنسمکانیسم های بیوسنتز پلی ساکارید ، مطالعات رونویسی را بر روی Atriplex- غنی می کندسستنسسیستم ها ، و نوآوری را با کیفیت بالا ارتقا می بخشدسستنسمنابع ژرم پلاسم.

 

مواد و روشها

1.1 مواد آزمایشی

کوارترینمونه انگلهالکسیلون آمودندرونوتقوطی های Atriplexازسستنسپایگاه کشت درشهر Xiquan ، شهرستان Jingtai ، استان گانسو(عرض جغرافیایی36 درجه 5 'n، طول جغرافیایی103 درجه 42 'e). هر دوهالوکیلونوتقوطی های Atriplexدر همان محیط کشت می شدند. نمونه ها به عنوان طبقه بندی شدندhaloxylon-سستنس(نمونه الف)وتatriplex-سستنس(نمونه H) ،با سه تکرار برای هر گروه (پنج گیاه در هر تکرار). نمونه برداری درآوریل 2024، و نمونه ها به عنوان مشخص شدندکوارتریلامپ های گوشتی توسطپروفسور گوو یاهونگازدانشکده کشاورزی ، دانشگاه کشاورزی گانسو.

پیرویدستورالعمل های نمونه برداری شرکت Biotech Shanghai OE ، آموزشی ویبولیتین،سستنسساقه های گوشتی با آب فوق العاده شستشو داده شد و رطوبت اضافی با استفاده از کاغذ فیلتر برداشته شد. برش های نازک ازبالا ، میانه و پاییناز هر ساقه ، کاملاً مخلوط شده و در ویال های کرایوژنیک قرار می گیرد. نمونه ها بودندبه سرعت در نیتروژن مایع منجمد شدبرای2 ساعتقبل از انتقال به afree free {0}} درجه فریزربرای ذخیره سازی [7].

1.2 روش آزمایشی

1.2.1 ایجاد منحنی استاندارد و تعیین محتوای پلی ساکارید

A 10 میلی گرمنمونه ازاستاندارد D- گلوکزبا دقت وزن و در a حل شد100 میلی لیتر فلاسک حجمیبا آب مقطر برای تهیه a100 ug · ml⁻ راه حل سهامبشر راه حل های کالیبراسیون از{{0}}. 2 ، 0 4 ، 0. 6 ، 0. 7 ، 0. 8 ، و 0.9 mlمحلول سهام بهلوله های آزمایشی 10 میلی لیتر، با آب رقیق شده به1. 0 ml، و سپس با مخلوط1. {1}} ml از 6 ٪ محلول فنلوت5 میلی لیتر اسید سولفوریک غلیظبشر پس از گرداب ، محلول ها در یک حمام آب جوش گرم شدند20 دقیقه، سپس در یک حمام آب یخ خنک شد10 دقیقه. A کنترلبا استفاده از1. 0 میلی لیتر آب مقطربه جای محلول گلوکز. میزان جذب در اندازه گیری شد482 نانومتربا استفاده از aطیف سنج UV-vis، و الفمنحنی استانداردبا تولیدغلظت (x) به عنوان محور افقیوتجذب (y) به عنوان محور عمودی.

به دنبال یک رویکرد اصلاح شده ازلی جی و همکاران [8], 0. 2 گرم خشک شدهسستنسپودربا دقت وزن شد و در a قرار گرفتلوله تست جلوی 20 میلی لیتر. 10 میلی لیتر از 80 ٪ اتانولاضافه شد ، و مخلوط در معرض آن قرار گرفتاستخراج اولتراسونیک در 80 درجه (100 W ، 40 کیلوهرتز) به مدت 30 دقیقهبشر عصاره در حالی که داغ فیلتر شد و روش یک بار تکرار شد. پس از خشک کردن باقیمانده ،10 میلی لیتر آب مقطراضافه شد ، و استخراج اولتراسونیک دو بار تکرار شد. فیلترها با هم ترکیب و رقیق شدند20 میلی لیتربا آب مقطر1. {{1} ml از این راه حلبیشتر رقیق شد10 میلی لیتربا آب مقطر

A 1.از آمادهسستنسمحلول نمونه با استفاده از همان روش استاندارد گلوکز مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. جذب در482 نانومتراندازه گیری شد ، و محتوای پلی ساکاریدسستنساز گیاهان میزبان مختلف محاسبه شد.

1.2.2 استخراج RNA ، ساخت کتابخانه cDNA و توالی

RNA کل از استخراج شدکوارترینمونه انگلهالکسیلون آمودندرونوتقوطی های Atriplexبا استفاده ازکیت Tiangen DP441 RNA (چین)، به دنبالپروتکل معرف TRIZOLبشر خلوص RNA با یک ارزیابی شدطیف سنجی Nanodrop 2000 (Thermo Scientific ، USA)، در حالی که غلظت RNA و یکپارچگی با استفاده از یک مورد ارزیابی شدAgilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies ، ایالات متحده).

کتابخانه های متن با استفاده ازکیت آماده سازی کتابخانه جهانی VAHTS UNIVERSAL V6 RNA-SEQبشر پس از کنترل کیفیت باAgilent 2100 Bioanalyzer، کتابخانه ها درپلت فرم Illumina Novaseq 6000، تولید150 جفت باز می خواند.

1.3 تجزیه و تحلیل داده ها

1.3.1 مونتاژ رونویسی و حاشیه نویسی عملکردی

RAW خوانده می شودقالب FastQبا استفاده از پردازش شدندکوچکحذفPloy-n می خواند و با کیفیت پایین می خواند، در نتیجهخواندنی ها را تمیز کنیدبشر توالی آداپتور و مناطق با کیفیت پایین برداشته شد ، و خواندن تمیز در آن جمع آوری شدادعای(برچسب های توالی بیان شده) با استفاده ازنرم افزار تثلیثبشر طولانی ترین متن از هر خوشه به عنوان یک انتخاب شدیکباربرای تجزیه و تحلیل بیشتر

حاشیه نویسی عملکردی Unigenes با مقایسه آنها در برابرپایگاه داده پروتئین غیر مجرد (NR) NCBI ،-پروتئین سوئیس و تبارشناسی تکاملی ژن ها: گروههای ارتولوگ غیر قابل نظارت (EGGNOG)با استفاده ازنرم افزار الماس (e-value <1e -5). حاشیه نویسی گروههای ارتولوگ (KOG)برای شناسایی ژنهای همولوگ انجام شد. علاوه بر این ، Unigenes نقشه برداری شددائر ycl المعارف کیوتو از ژن ها و ژنوم ها (KEGG)برای حاشیه نویسی مسیر متابولیک.طبقه بندی هستی شناسی ژن (GO) و حاشیه نویسی عملکردیبا استفاده از نقشه برداری از بانک اطلاعاتی سوئیس-پروتئین انجام شد.

1.3.2 تجزیه و تحلیل بیان ژن و شناسایی Unigenes متفاوت بیان شده (DEG)

سطح بیان ژن با استفاده از اندازه گیری شدbowtie2برای تراز خواندن تمیز به Unigenes. مقادیر بیان به عنوان محاسبه شدقطعات در هر کیلوباز متن در هر میلیون خوانده شده نقشه برداری (FPKM)با استفاده ازنرم افزار اکسپرسبشر تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل با استفاده ازنرم افزار deseq2، باآزمایش های توزیع دوتایی منفی (NB)برای آزمایش اهمیت استفاده می شود. ژنهای متفاوت بیان شده (DEG) به عنوان آنهایی که با آنها تعریف شده اندq-value <0. 05وتتغییر برابر (FC)> 2.

1.3.3 اعتبار سنجی qRT-PCR ژنهای متفاوت بیان شده

ژنهای آنزیم کلیدی درگیر دربیوسنتز پلی ساکاریدبابیان دیفرانسیل قابل توجهیبرایاعتبار سنجی کمی در زمان واقعی (qRT-PCR)بشر نمونه های RNA با کیفیت بررسی شدند و مقادیر OD قبل از رونویسی معکوس اندازه گیری شد. سنتز cDNA با استفاده ازTransScript all-in-on-on-on-strand cDNA Supermix برای کیت qPCRبشر cDNA سنتز شده رقیق شد10- برابر، و qRT-PCR با استفاده از a انجام شدسیستم qPCR فلورسنتدر شرایط مختلف دوچرخه سواری.ACTB (بتا اکتین) به عنوان یک ژن مرجع داخلی استفاده شد، و سطح بیان ژن نسبی با استفاده ازروش 2⁻ δδCT.

 

جدول 1 توالی آغازگر

شناسه ژن	نام ژن	آغازگر رو به جلو (5 '-3')	آغازگر معکوس (5 '-3')
Trinity _ dn 21412_ c 0_ g 1_ i 1_2	GMPP	gatagtggctacaacatccactt	cctcctcttcgtcgtagattc
Trinity _ dn 30174_ c 0_ g 1_ i 17_2	PFP	tatatgggaccatggaaccaa	gaccataggcgtgatcgatc
Trinity _ dn 25715_ c 0_ g 2_ i 4_1	اوگد	aaagatcttccagttcgtaagc	accaattcgttgatgctacc
Trinity _ dn 28766_ c 1_ g 1_ i 6_1	لاک	gtctccttgttattcgtgagat	gtcgatggtgtgaagcagat
Trinity _ dn 24102_ c 0_ g 6_ i 1_1	ساحلی	ttacgaggatagtgagtgcta	aatggaagatgaggagtga
Trinity _ dn 21508_ c 1_ g 2_ i 4_2	لاک	GGCACAGTCAAGGAGTACGATG	کاکتهای
-	عمل	caatggatgatatcgcgcgt	کاکتهای

 

 

1.4 تجزیه و تحلیل داده ها

تجزیه و تحلیل خوشه بندی سلسله مراتبی ازژنهای متفاوت بیان شده (DEG)با استفاده از انجام شدR (v3.2.0)برای تجسم الگوهای بیان ژن در گروه ها و نمونه ها. برو (ژن هستی شناسی) تجزیه و تحلیل غنی سازی وتجزیه و تحلیل غنی سازی مسیر KEGG (دائر ycl المعارف کیوتو از ژن ها و ژنوم ها)با استفاده ازR، بر اساستوزیع بیش از حد سنجشبشر اصطلاحات عملکردی به طور قابل توجهی غنی شده با استفاده از نمایش داده شدنمودارهای نوار ، توطئه های حباب و توطئه های دایره غنی سازی.

2 نتیجه و تجزیه و تحلیل

2.1 نتایج تعیین محتوای پلی ساکارید

معادله رگرسیون خطی به دست آمده از اندازه گیری های جذب:

y {{0}}. 0 154x -0.1636 (r {{4}. 9963) y=0. 0154x {{8}. 1636 \ Quad quad .

با دامنه خطی از20-90 ug · ml⁻⁻بشر دقت ، تکرارپذیری ، ثبات و میزان بازیابی نمونه بود{{0}}. 38 ٪ ، 0. {3}} ، ، 0.53 ٪ و 99.67 ٪، به ترتیب

اندازه گیری شدهمحتوای پلی ساکاریددرکوارترینمونه هایی از گیاهان میزبان مختلف عبارت بودند از:

haloxylon-سستنس: 6.51%

atriplex-سستنس: 11.83%

2.2 توالی رونویسی و مونتاژ داده ها

توالی رونویسی ازشش نمونهدر مجموع تولید کرد41.77 گرم از داده های تمیزبشر داده های معتبر در هر نمونه از6.89 گرم تا 7.04 گرم، بادرصد پایه Q30 بین 95.38 ٪ و 95.91 ٪، ومیانگین محتوای GC 45.13 ٪.

در کل61،423 unigenesمونتاژ شده ، با طول کل65،962،858 BPوطول متوسط ​​1،073.91 bp.

2.3 حاشیه نویسی عملکردی ژن

در کل61،423 unigenesاز توالی حاصل شدکوارترینمونه ها دو گیاه میزبان مختلف را انگل می کنند. نتایج حاشیه نویسی به شرح زیر است:

30،689 Unigen (49.96 ٪)حاشیه نویسی درپایگاه داده پروتئین NR (غیر اعتبار).

18،698 Unigen (30.44 ٪)حاشیه نویسی دربانک اطلاعات.

3،998 یونی (6.51 ٪)حاشیه نویسی درپایگاه داده.

17،188 یونی (27.98 ٪)حاشیه نویسی درپایگاه داده KOG (گروههای ارتولوگ یوکاریوتی).

25،280 یونی (41.16 ٪)حاشیه نویسی درeggnog (تبارشناسی تکاملی ژن ها: گروههای ارتولوگ غیر تحت نظارت) پایگاه داده.

16،210 Unigen (26.39 ٪)حاشیه نویسی درپایگاه داده برو (هستی شناسی ژن).

16153 یون ژن (26.30 ٪)حاشیه نویسی درپایگاه داده PFAM (خانواده های پروتئین).

در میان اینها ،21،650 یونیطولانی تر از1 کیلوبایت.

تجزیه و تحلیل همسانی بر اساسپایگاه دادهفاش کرد که سه گونه برتر از نزدیک:

Paulownia Fortunei (30.23 ٪)

Phtheirospermum japonicum (14.15 ٪)

Chenopodium quinoa (7.1 ٪)

 

 

جدول 2 اطلاعات حاشیه نویسیکوارتریتابع ژن

بخش پایگاه داده	شماره ژن حاشیه نویسی	نسبت (٪)
شماره	30,689	49.96
دارای پیش بینی سوئیسی	18,698	30.44
کله زدن	3,998	6.51
کنگره	17,188	27.98
گنگ	25,280	41.16
رفتن	16,210	26.39

 

 

2.4 GO و KEGG حاشیه نویسی و طبقه بندی عملکردی

درپایگاه داده برو (هستی شناسی ژن)برای حاشیه نویسی بیشتر Unigenes مشخص شده درپایگاه داده، در نتیجه در کل16،210 یونیبشر این یونانی ها به طبقه بندی شدندسه گروه اصلی کاربردی:

فرآیند بیولوژیکی (BP)

عملکرد مولکولی (MF)

مؤلفه سلولی (CC)

دردسته فرآیند بیولوژیکی (BP)، فراوان ترین خوشه های Unigene عبارتند از:

"فرآیند سلولی" (11،023 unigenes)

"روند متابولیک" (9،117 یونی)

برایدسته مؤلفه سلولی (CC), 17 زیر شاخهمشخص شد ، با هر زیر شاخه حداقل30 یوناینبشر بزرگترین خوشه ها عبارت بودند از:

"سلول" (13،947 یون ژن)

"قسمت سلول" (13.918 یون ژن)

دردسته عملکرد مولکولی (MF)، غنی ترین گروه های عملکردی عبارت بودند از:

"الزام آور" (10،039 یونی)

"فعالیت کاتالیزوری" (8،490 unigenes)

شکل 2 حاشیه نویسی عملکردی و طبقه بندی Unigenes

 

حاشیه نویسی عملکردی KEGG و طبقه بندی

در طولتوالی رونویسی، در کل3،998 unigenesحاشیه نویسی درپایگاه داده KEGG (دائر ycl المعارف کیوتو ژن و ژنوم)بشر این یونانی ها به طبقه بندی شدندشش دسته اصلی، با شمارش و نسبت های مربوط به آنها به شرح زیر:

فرآیندهای سلولی: 326 یونی (8.15%)

پردازش اطلاعات زیست محیطی: 299 یونی (7.47%)

پردازش اطلاعات ژنتیکی: 1،771 یونی (44.30%)

بیماری های انسانی: 14 unigenes (0.35%)

متابولیسم: 1،465 یونی (36.64%)

سیستم های ارگانیسم: 123 یونی (3.07%)

این شش دسته اصلی بیشتر به20 سطح طبقه بندی ثانویهبشر در میان آنها ،پردازش اطلاعات ژنتیکیبالاترین نسبت را داشت و پس از آنمتابولیسمبشر درمتابولیسمدسته ، فراوان ترین مسیرها این بود:

متابولیسم کربوهیدرات

متابولیسم اسید چرب

متابولیسم فلاونوئید

شکل 3 حاشیه نویسی مسیر متابولیک kegg unigenes

 

2.5 بیان ژن دیفرانسیل و تجزیه و تحلیل غنی سازیکوارتریاز میزبان های مختلف

داده های توالی رونوشت با استفاده ازمعیارهای انتخاب بیان دیفرانسیل پیش فرض، در نتیجه شناسایی14،089 ژن متفاوت بیان شده (DEG):

6،576 ژن تنظیم شد

7،513 ژن تنظیم شدند

A طرح آتشفشانبرای تجسم توزیع کلی DEG ها تولید شد.

درطبقه بندی های عملکردی غنی سازی 30 GO TOPاز DEG ، مشاهده شد که:

در مقایسه بافرآیند بیولوژیکی (BP)وتمؤلفه سلولی (CC)دسته بندی ها ،عملکرد مولکولی (MF)غنی سازی DEG قابل توجه تر به نمایش گذاشت.

مهمترین DEG های غنی شده با آن همراه بودندمتابولیسم اسید نوکلئیک ، متابولیسم پروتئین و آنزیم های کلیدی در متابولیسم گالاکتوز.

علاوه بر این ، DEG ها به طور قابل توجهی غنی شدندGO اصطلاحات مربوط به متابولیسم پلی ساکارید، از جمله:

روند متابولیک نشاسته

فرآیند بیوسنتتیک گلیکوژن

فرآیند کاتابولیک ساکارز

فعالیت گلوکزیداز

فعالیت udp-l-rhamnose synthase

فعالیت هیدرولاز پلی ساکارید

شکل 4 نقشه آتشفشانی ژنهای متفاوت بیان شده

 

تجزیه و تحلیل غنی سازی مسیر KEGG از DEG ها درکوارتریاز میزبان های مختلف

برای تحقیق بیشترژنهای متفاوت بیان شده (DEG)درکوارتریاز گیاهان میزبان مختلف ،تجزیه و تحلیل غنی سازی مسیر KEGGانجام شد تجزیه و تحلیل نشان داد که:

DEG ها به 117 مسیر متابولیک نقشه برداری شدند.

در20 مسیر برترنشانغنی سازی قابل توجه DEG، با غنی ترین مسیرهای از جمله:

متابولیسم اسید چرب

-بلیسم اسید لینلنیک

متابولیسم گالاکتوز

تخریب لیزین

تجزیه و تحلیل غنی سازی بیشتر از20 دسته متابولیک برتر با کوچکترین مقادیر Qنشان داد که DEG ها به طور قابل توجهی در:

سیستم های ارگانیسم

متابولیسم

پردازش اطلاعات ژنتیکی

در میان این دسته ها ،"متابولیسم"بیشترین تعداد DEG های غنی شده را داشت و مهمترین غنی سازی را نشان داد. علاوه بر این ، در مسیرهای متابولیک غنی شده ،نسبت یون های تنظیم شده و تنظیم شده تقریباً برابر بود.

این یافته ها نشان می دهد کهمسیرهای متابولیکی نقش مهمی ایفا می کننددر بیان ژن دیفرانسیلکوارتریاز گیاهان میزبان مختلف ، به ویژه درلیپید ، کربوهیدرات و متابولیسم اسید آمینه.