مطالعه موردی-شاهدی عفونت کلستریدیوم اینوکوم، تایوان

Clostridium innocuum مقاوم به وانکومایسیناخیراً به عنوان یک عامل اتیولوژیک برایاسهال مرتبط با آنتی بیوتیکدر انسان ما یک مطالعه مورد-شاهدی را شامل 152 بیمار مبتلا به تلقیح C. از 2{13}}14–2019 در تایوان انجام دادیم، با استفاده از 304 مورد عفونت Clostridioides diffi - cile (CDI) که با سال تشخیص، سن ({{7) مطابقت داشتند. }} سال)، و جنسیت به عنوان کنترل. ویژگی های پایه بین 2 گروه مشابه بود. بیماران آلوده به تلقیح C. نسبت به بیماران مبتلا به CDI، عفونت کلستریدیایی خارج روده ای و عوارض مربوط به دستگاه گوارش را بیشتر تجربه کردند. نرخ مرگ و میر روزانه در بین بیماران مبتلا به C. innocuum 14.5٪ و میزان کلی 23.0٪ بود.بیماری مزمن کلیه, تومور جامد، بستری در بخش مراقبت های ویژه و وضعیت شوک 4 عامل خطر مستقل برای مرگ بودند. تلقیح C. شناسایی شده از نمونه های بالینی باید به عنوان یک پاتوژن نیازمند درمان شناخته شود و به دلیل مقاومت ذاتی وان-وانکومایسین، شناسایی دقیق برای هدایت درمان ضد میکروبی مناسب و به موقع ضروری است.

گیاهی که می دانیدبرای بیماری کلیوی

گونه های کلستریدیوم are obligate anaerobic, endo-spore-forming bacilli that usually colonize the gastrointestinal tracts of humans. Of the >200 species of Clostridium, >30 پاتوژن های بالقوه در انسان هستند، مانند C. perfringens و Clostridioides diffi-cile. با این حال، C. innocuum به ندرت به عنوان مرتبط با بیماری های انسانی توصیف شده است. تلقیح C. اولین بار در دهه 1960 در بین 8 بیمار در ایالات متحده شناسایی شد. نام، invacuum، فقدان حدت آن را توصیف می کند (1،2). تمایز تلقیح C. از دیگر چالش برانگیز بود

گونه های کلستریدیوم (مخصوصاً C. ramosum و C. clostridia که با هم گروه RIC نامیده می شوند) به دلیل فنوتیپ های مشابه مورفولوژی استعماری آتیپیک، ویژگی های تشکیل دهنده هاگ نادر و الگوی اسید چرب آنها (3-5). شناسایی تلقیح C. پس از معرفی تکنیک‌های مولکولی مانند توالی‌یابی RNA 16S و طیف‌سنجی جرمی دفعی/یونیزاسیون لیزری مرتبط با ماتریس (MALDI-TOF) سریع‌تر و دقیق‌تر شده است (6).

در سال 1995، کوترونا و همکاران. اولین مورد اندوکاردیت ناشی از C. innocuum را گزارش کرد (7). اگرچه قبلاً این باکتری کمتر بیماری زا در نظر گرفته می شد و به ندرت باعث عفونت می شد، شواهد بالینی بیشتری از دهه 2000 به دست آمد که نشان می داد C. تلقیح ممکن است یک علت بالقوه اسهال مرتبط با آنتی بیوتیک و عفونت کلستریدیایی خارج روده ای (EICI) مانند باکتریمی باشد. عفونت داخل شکمی و اندوکاردیت (8-10). با این حال، ما از مطالعه ای در مورد عفونت C. innocuum با گروهی از بیماران به اندازه کافی برای توصیف ویژگی های بالینی آن آگاه نیستیم.

تشخیص دقیق C. inoculum به دلیل مقاومت ذاتی منحصر به فرد آن در برابر وانکومایسین، که احتمالاً ناشی از حضور 2 ژن کروموزومی است که سنتز یک پیش ساز پپتید-گلیکان را قادر می سازد در سرین با میل ترکیبی کم وانکومایسین به پایان می رسد، ضروری است (9،11). اگرچه وانکومایسین یکی از داروهای ضد میکروبی توصیه شده برای درمان عفونت های ناشی از گونه های کلستریدیوم، به ویژه C. difficile است، مقاومت ذاتی به وانکومایسین در C. inoculum خطر درمان نامناسب را برای بیماران مبتلا به عفونت C. inoculum ایجاد می کند (12). C. difficile یکی از معرف ترین گونه های سه گانه نزدیک برای ایجاد بیماری های انسانی است و به خوبی مورد بررسی قرار گرفته است. در ایالات متحده، سالانه ≈500،000 عفونت شناسایی شد، و 15،{8}}-30،{10}} مرگ با عفونت C. difficile (CDI) مرتبط بود (12-14)

در مطالعات قبلی، ما C. innocum را به عنوان یک پاتوژن مهاجم بالقوه نشان دادیم که باعث ایجاد کولیت شدید و EICI در یک سری موارد کوچک می شود و سمیت سلولی آن را در شرایط آزمایشگاهی ثابت کردیم (8،9). در اینجا، ما یک مطالعه مورد-شاهدی گذشته‌نگر را برای توصیف و ارزیابی ویژگی‌های بالینی و پیامدهای عفونت‌های ناشی از C. inoculum انجام دادیم. برای این منظور، بیماران مبتلا به CDI را به عنوان گروه کنترل انتخاب کردیم. هیئت‌های بررسی موسسه در بیمارستان چانگ گونگ مموریال (CGMH؛ تائویوان، تایوان) این مطالعه را تأیید کردند و امکان بررسی داده‌های پزشکی بیماران را فراهم کردند (IRB#201900906B0). با توجه به ماهیت گذشته نگر پروژه و تجزیه و تحلیل ناشناس اطلاعات بالینی بیماران، چشم پوشی از رضایت داده شد.

روش ها

طراحی مطالعه، تنظیمات بالینی، و ثبت نام مورد

We conducted a retrospective case-control study at CGMH during 2014–2019. CGMH is a tertiary medical center accommodating 3,700 patient beds. We selected C. difficile as the control to better illustrate the clinical features of C. innocuum infection. The case and control groups were assigned in a 1:2 ratio and matched in the diagnosed year, age +2 years, and sex. We identified cases with C. innocuum and C. difficile infections using the rapid ID 32A system (bioMérieux, https://www.biomerieux.com) and MALDI-TOF mass spectrometry Biotyper (Bruker Daltonik GmbH, https://www.bruker.com) (15– 17). MALDI-TOF mass spectrometry was introduced in 2009 in the clinical microbiology laboratory of CGMH, but C. innocuum was not reported routinely because it was considered a clinically insignificant microorganism. To trace the cases infected with C. inoculum, we reviewed the original reporting database from the MALDI-TOF mass spectrometry system directly and identified the samples reporting C. inoculum. Our definition of a microbiologically confirmed C. inoculum infection was that the original report from the MALDI-TOF mass spectrometry database revealed C. inoculum in the strongest 2 signals and had signal scores >2.{1}}. ما عفونت های C. difficile را با همان منطق تعریف کردیم. ما اطلاعات پایه هر بیمار را بررسی کردیم و همه بیماران مبتلا به عفونت C. inoculum را در مطالعه قرار دادیم. ما عفونت C. difficile را به عنوان یک سنجش سمی مبتنی بر PCR مثبت با حضور علائم بالینی سازگار با عفونت، یا کشت مثبت C. difficile با علائم بالینی سازگار (مانند اسهال مستند یا ویژگی‌های رادیولوژیک مگاکولون سمی) تعریف کردیم. ما مواردی را با C. inoculum و C. difficile جدا شده از یک نمونه بالینی از مطالعه حذف کردیم. برای تطبیق مورد-شاهد، 3 نویسنده (Y.-C. Chen، Y.-C. Kuo، و M.-C. Chen) اطلاعات پایه همه موارد مبتلا به عفونت C. innocuum و C. difficile را بررسی کردند. ما به طور تصادفی 2 کنترل را برای هر مورد انتخاب کردیم که بر اساس سال تشخیصی، سن (+2 سال) و جنسیت مورد شاخص مطابقت داشت. اگر هیچ کنترلی از بین این 3 متغیر منطبق واجد شرایط نبود، معیار جنسیت و در صورت لزوم معیار سن را حذف می‌کنیم. پس از انجام فرآیند تطبیق، اطلاعات بالینی این بیماران را بیشتر بررسی کردیم.

منابع داده های بالینی، متغیرها و تعریف

We collected demographic data, clinical manifestations, laboratory testing results, images, and mimicrobiology reports through an electronic medical record system (EMR). Demographic data were age, sex, race, underlying systemic diseases, and acquisition modality (community vs. hospital). We defined hospital-acquired infection as the symptoms that occurred>48 ساعت پس از پذیرش، یا<4 weeks after discharge from a healthcare facility; otherwise, it was classified as a community-acquired infection (18). We calculated the Charlson Comorbidity Index score for each patient to represent the baseline physiologic condition affected by an underlying disease. The index is composed of 19 underlying conditions in 4 categories. Each category had a weighted score based on the risk for 1- and 10-year mortality rate (19). We recorded clinical symptoms such as diarrhea, fever, bloody stool, abdominal pain, vomiting, and abdominal distension. We also reviewed disease-related complications, including toxic megacolon, ileus, bowel perforation, and shock. Recurrent infection was defined if the patient had a repeated microbiological culture from the same specimen source within 8 weeks of initial documented symptoms resolution (20,21). Outcome assessment includeed 30-day, 90-day, and overall deaths after the infection. We reviewed previous antibiotic exposures according to each class: penicillins, cephalosporins, carbapenems, fluoroquinolones, aminoglycosides, macrolides, tetracyclines, glycopeptides, oxazolines, polymyxins, lincosamides, and metronidazole. We defined antibiotic exposure rates as the percentage of patients who received any drugs <30 days before C. inoculum or C. difficile infection and duration of antibiotic exposure as the total days of any antimicrobial drug use in a patient <30 days before the event of C. inoculum or C. difficile infection.

جداسازی و شناسایی باکتری

ما کشت های باکتریایی بی هوازی را در آزمایشگاه میکروبیولوژی بالینی انجام دادیم، همانطور که قبلا توضیح داده شد (9). ما تمام نمونه‌های بی‌هوازی را روی صفحه آگار انتخابی، از جمله CDC-ANA BAP (صفحه آگار بی‌هوازی خون)، CDC-ANA-PEA (پلیت بی‌هوازی فنیل اتیل الکل خون)، و BBE/KVLB (Bacteroides bile esculin و کانامایسین لیک) روی صفحه آگار انتخاب کردیم. دو صفحه صفحات آگار را در شرایط هوازی (90% N2 / 10% CO2) در دمای 37 درجه به مدت 5 روز انکوبه کردیم. ما کلنی‌های در حال رشد را در یک صفحه بررسی کردیم و 1 کلنی نماینده را برای هر صفحه آگار توسط سیستم سریع ID 32A (bioMérieux) برای شناسایی میکروارگانیسم‌ها تجزیه و تحلیل کردیم.

جدول 1. ویژگی های پایه و تشخیص های بالینی در 2 گروه از بیماران توسط گونه های آلوده کننده کلستریدیوم در مطالعه مورد شاهدی عفونت C. inoculum، تایوان*

تست حساسیت ضد میکروبی

ما حساسیت های ضد میکروبی را به کلیندامایسین، مترونیدازول، پنی سیلین، پیپراسیلین و آمپی سیلین/سولباکتام با روش رقت نقطه شکست آگار مطابق با معیارهای موسسه استانداردهای بالینی و آزمایشگاهی (سند M11-A8) برای یک باکتری هوازی آزمایش کردیم (22) . ما از معیارهای تفسیری در سند M100S برای تعیین حساسیت استفاده کردیم (22).

تجزیه و تحلیل آماری

ما تجزیه و تحلیل آماری را توسط SPSS Statistics 24 انجام دادیم.{1}} (SPSS Inc., https://www.ibm.com/products/ spss-statistics). برای متغیرهای پیوسته، با استفاده از آزمون t مستقل یا آزمون U Mann-Whitney در صورت لزوم، معناداری را تعیین کردیم. اگر متغیر پیوسته دارای نقاط پرت بود و با توزیع نرمال مطابقت نداشت، متغیرها به عنوان میانه (محدوده بین چارکی، محدوده) نشان داده می شدند. متغیرهای طبقه‌بندی را با آزمون χ2 تجزیه و تحلیل کردیم و p را در نظر گرفتیم<0.05 statistically significant. We obtained odds ratios (ORs) from cross-tabulation and analyzed the p-value of ORs by univariate logistic regression. We estimated the mortality rate at 30 days and 90 days after the positive culture and analyzed it by Kaplan-Meier survival analysis using methods described previously (23). In addition, we examined risk factors associated with 30- and 90-day mortality in both groups by logistic regression.