بررسی مکانیسم اثر گلیکوزیدهای کل سیستانچ بر بیماری التهابی روده بر اساس فارماکولوژی شبکه و آزمایشات حیوانی Ⅱ

Mar 29, 2024

2 روش های تست

2.1 تجزیه و تحلیل فارماکولوژی شبکه

2.1.1 مواد موثره سیستانچ دسرتیکولا

بر اساس مطالعات موجود [7، 22]، "Echinacoside"، "ورباسکوزید", "سیستانوزید A", "توبولوزید A", "ایزواکتئوزید", "2-استیلاکتئوزید"و"توبولوزید B" به عنوان اجزای فعال زیستی برای تجزیه و تحلیل انتخاب شدند. داده های ساختار شیمیایی سه بعدی هفت ماده فوق را از طریق Pubchem (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) پیدا کنید و آنها را در قالب sdf ذخیره کنید.


2.1.2 پیش بینی و غربالگری اهداف بالقوه

فایل های ساختار سه بعدی را وارد کنیدمواد فعال در پایگاه داده PharmMapper(http://lilab-ecust.cn/pharmmapper/index.html). "فقط اهداف پروتئین انسانی" را به عنوان گونه هدف انتخاب کنید و گزینه های دیگر را به عنوان پیش فرض نگه دارید تا داده های مربوط به مواد مختلف را بدست آورید. هدف هدف مربوطه

پایگاه داده UniProt (https://www.uniprot.org/) برای به دست آوردن اطلاعات نام پروتئین و نام ژن مربوط به هر هدف استفاده شد. نقاط هدف مربوط به 7 جزء را ادغام کنید.

در پایگاه داده GeneCards (https://www.genecards.org/)، از "بیماری التهابی روده" به عنوان کلمه کلیدی برای جستجوی ژن های مرتبط با بیماری التهابی روده و سازماندهی نتایج جستجو استفاده کنید.

Cistanche Total Glycosides On Inflammatory Bowel Disease

cistanche order

مکمل سیستانچ مکمل حمایتی ضد التهابی PhGs75% Ech 30% Act 12%


2.1.3 برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI)

ساخت شبکه از jvenn (https:/jvenn.toulouse.inrae.fr/app/example.html) برای ترسیم نمودار ون به صورت آنلاین برای به دست آوردن تقاطع اهداف ماده فعال Cistanche deserticola و اهداف IBD استفاده کنید. اهداف تقاطع به دست آمده را برای تجزیه و تحلیل غربالگری PPI در پایگاه داده String بارگذاری کنید. فایل TSV شبکه PPI را دانلود کنید، آن را به Cytoscape 3.8 وارد کنید.{2}}، مقدار درجه شبکه تعامل پروتئین را محاسبه کنید و سپس نمودار شبکه PPI را بر اساس مقدار درجه زیبا کنید.


2.1.4 هستی شناسی ژن (GO)

تجزیه و تحلیل مسیر غنی‌سازی عملکردی و دایره‌المعارف ژن‌ها و ژنوم کیوتو (KEGG) با استفاده از پایگاه داده DAVID (https://david.ncifcrf.gov/) برای شناسایی اهداف اثرات محافظتی مواد فعال Cistanche deserticola بر IBD انجام شد. تجزیه و تحلیل GO بر روی نقاط انجام شد، و سپس پایگاه داده DAVID برای انجام تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مسیر KEGG بر روی اهدافی که در آن مواد فعال Cistanche deserticola نقش محافظتی در IBD دارند، استفاده شد.

cistanche for inflammatory bowel (8)

2.1.5 ساخت شبکه Cistanche deserticola "ماده فعال-هدف-مسیر"

مواد فعال سیستانش دسرتیکولا، اهداف تقاطع مواد فعال سیستانش دسرتیکولا و IBD و مسیرهای غنی شده توسط KEGG برای ساخت یک شبکه ماده فعال-هدف-مسیر استفاده شد.


2.2 اعتبار سنجی مدل حیوانی

2.2.1 ایجاد مدل حیوانی

موش‌های نر BALB/c با درجه SPF (5 تا 8 هفته، 18 تا 21 گرم) مورد استفاده قرار گرفتند که توسط مرکز تست غذای بهداشتی دانشکده هنرهای کاربردی و علوم، دانشگاه اتحادیه پکن [شماره مجوز استفاده از حیوانات آزمایشی: SYXK (Beijing) ) 2017-0038]، آنها در اتاق حیوانات با درجه SPF با دمای (2±23) درجه، رطوبت نسبی 50٪ تا 70٪ و 12 ساعت قرار گرفتن در معرض نور فلورسنت متناوب در روز و شب نگهداری شدند. . پروتکل‌های آزمایش حیوانی همگی توسط آزمایشگاه حیوانات مرکز آزمایش غذای بهداشتی، دانشکده علوم و هنرهای کاربردی، دانشگاه اتحادیه پکن تأیید شدند. پس از تغذیه تطبیقی ​​به مدت 3 روز، 20 موش به طور تصادفی بر اساس وزن بدن به 4 گروه و در هر گروه 5 موش تقسیم شدند. ①گروه کنترل (CZ): آب استریل را آزادانه بنوشید و آب استریل را به مدت 7 روز متوالی گاواژ کنید. ②گروه کنترل DSS

(DZ): نوشیدن رایگان محلول 3٪ DSS که روزانه به مدت 7 روز متوالی تهیه می شود. ③ گروه با دوز پایین از کل گلیکوزیدهای Cistanche deserticola (LZ) (غلظت مایع: 0.1 گرم در میلی لیتر): نوشیدنی رایگان محلول 3٪ DSS روزانه به مدت 7 روز تهیه می شود. مایع گاواژ به مدت 7 روز متوالی; ④ Cistanche deserticola تام گلیکوزیدهای گروه با دوز بالا (HZ) (غلظت مایع 0.4 گرم /

میلی لیتر): محلول تازه تهیه شده 3% DSS را هر روز آزادانه بنوشید و به مدت 7 روز متوالی محلول را با گاواژ بدهید. پس از 7 روز مدل سازی مداوم، 12 ساعت ناشتا بودند و سپس با دررفتگی دهانه رحم قربانی شدند. گلبول های قرمز مرغ 4 ساعت قبل از اعدام به صورت داخل صفاقی تزریق شد. بلافاصله پس از اعدام، کره چشم برای جمع آوری خون برداشته شد. مایع صفاقی خارج و حفره شکمی باز شد. طول کولون اندازه گیری شد و طحال موش، گره پیر و سایر اندام ها برداشته شد.

Flavonoid (8)

مکمل سیستانچ مکمل حمایتی ضد التهابی

2.2.2 شاخص فعالیت بیماری (DAI)

موش‌ها قبل از تزریق داخل معده هر روز در ساعت معینی وزن شدند و وضعیت روانی و خواص مدفوع موش‌ها مشاهده شد. خون مخفی مدفوع اندازه گیری و بر اساس آن نمره گذاری شد. استانداردهای امتیازدهی در جدول 1 نشان داده شده است. امتیاز DAI=(امتیاز وزن بدن + امتیاز شخصیت مدفوع + امتیاز خون مخفی مدفوع)/3 (1)

جدول 1 معیارهای امتیازدهی DAI

Cistanche Total Glycosides On Inflammatory Bowel Disease

2.2.3 تشخیص فلورسانس کمی PCR تشخیص مسیر سیگنال ایمنی (qRT-PCR)

طحال موش جمع آوری شد، به بلوک های بافتی 0.5 سانتی متری بریده شد و برای ذخیره در محلول تثبیت کننده RNA بافت خیس شد. بافت را بردارید و آن را به قطعات برش دهید، محلول استخراج RNA را اضافه کنید و به قطعات خرد کنید تا RNA کل استخراج شود. پس از رونویسی معکوس و تقویت PCR، فعال شدن دو مسیر سیگنالینگ ایمنی کلیدی mTOR و TGF- در طحال موش شناسایی شد. توالی پرایمرهای مورد استفاده در qRT-PCR در جدول 2 نشان داده شده است.

cistanche for inflammatory bowel (3)

جدول 2 جدول توالی پرایمر

Cistanche Total Glycosides On Inflammatory Bowel Disease


شما نیز ممکن است دوست داشته باشید