بخش 2 رابطه تنظیمی بین تنوع کیفیت و محیط زیست گیاه سیستانچ کویر در سه اکوتیپ بر اساس تجزیه و تحلیل میکروبیوم خاک

برای قسمت 1 اینجا را کلیک کنید

برای اطلاعات بیشتر لطفا تماس بگیرید:Joanna.jia@wecistanche.com

همبستگی بین فراوانی جامعه میکروبی کلیدی، محتوای PhGs و عوامل زیست محیطی.تجزیه و تحلیل اضافی هسته، فراوانی میکروبیوم بیومارکر، محتوای PhGs و عوامل اکولوژیکی در سطح سفارش انجام شد و تجزیه و تحلیل مجدد بر اساس اثرات انجام شد. تفسیر واریانس تعدیل شده 70/82 درصد بود (جدول S7). Sphingomonadales 45.7 درصد از محتوای PhGs را توضیح داد (p=0.002). Pseudonocardiales 22.4 درصد از محتوای PhGs را توضیح داد (p=0.01). 2'-acetylakteosid به طور قابل توجهی با Pseudonocardiales و Oceanospirillales و ارتباط منفی با Sphingomonadales داشت (شکل 5a). اکیناکوزید با Sphingomonadales مثبت بود.

سیستانچعصاره می تواند جلوگیری کندآلزایمرمرض

تجزیه و تحلیل همبستگی برای فراوانی نشانگرهای زیستی انجام شد،PhGمحتویات (شکل S3 و جدول S5)، و عوامل زیست محیطی (جدول S6). نتایج شبکه های همبستگی (شکل 5b) نشان داد که 2'-acetylakteosid به طور قابل توجهی با Oceanospirillales، Rhizobiales و Thiotricchales همبستگی مثبت داشت، در حالی که با Pseudonocardiales و Nitrosomonadales در تمام نمونه های خاک همبستگی منفی داشت. نقشه حرارتی (شکل 5c-e) نشان داد که Awa کنار میز با میانگین فشار بخار آب سالانه در نمک - قلیایی همبستگی منفی دارد.همبستگی بین فراوانی جامعه میکروبی کلیدی، محتوای PhGs و عوامل زیست محیطی.تجزیه و تحلیل اضافی هسته، فراوانی میکروبیوم بیومارکر،PhGsمحتوا و عوامل اکولوژیکی در سطح سفارش انجام شد و تحلیل مجدد بر اساس اثرات انجام شد. تفسیر واریانس تعدیل شده 70/82 درصد بود (جدول S7). Sphingomonadales 45.7 درصد از محتوای PhGs را توضیح داد (p=0.002). Pseudonocardiales 22.4 درصد از محتوای PhGs را توضیح داد (p=0.01). 2'-acetylakteosid به طور قابل توجهی با Pseudonocardiales و Oceanospirillales و ارتباط منفی با Sphingomonadales داشت (شکل 5a). اکیناکوزید با Sphingomonadales مثبت بود.

تجزیه و تحلیل همبستگی برای نشانگر زیستی abun I land انجام شد. در همین حال، سیستانوزید Awa به طور قابل توجهی با میکروکوکال ها و همبستگی منفی با Rhizobiales در زمین های شور-قلیایی همبستگی مثبت داشت (شکل 5c). در علفزار، 2'-acetylakteosid با میانگین دمای سالانه همبستگی منفی داشت (شکل 5d). در زمین های شنی، توبولوزید A با Nitrosomonadales همبستگی منفی داشت (شکل 5e).

عملکرد پیش بینی میکروبیوم باکتریایی در سه اکوتیپ C. deserticola - سایپرز، باشگاه دانشپروفایل های عملکردی میکروبیوم باکتریایی بر اساس تعداد کپی ژن 16S rRNA گونه های باکتریایی رمزگشایی شده با استفاده از Tax4Fun بر اساس گروه های KEGG Ortholog (KOs) پیش بینی شد. نتایج پیش‌بینی عملکردی (شکل 6) نشان داد که متابولیسم‌های عملکردی میکروبیوم‌های خاک در سه اکوتیپ C. deserticola یکسان است. در بین متابولیسم ها، کربوهیدرات، اسید آمینه، عوامل کوفاکتور و متابولیسم ویتامین و انرژی فراوان بود. حمل و نقل غشایی و انتقال سیگنال نیز در پردازش اطلاعات محیطی فراوان بود.

سیستانچعصاره داردضد التهابخواص

بحث

کار قبلی ما نشان داد که توالی psbA-turn و 2'-acetylakteosid می توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی و شیمیایی برای تشخیص استفاده شوند.C. بیاباناز سین کیانگ و مغولستان داخلی27. با بررسی‌های میدانی، متوجه شدیم که C. desertica عمدتاً در سه نوع زیستگاه زندگی می‌کند، از جمله زمین‌های شور-قلیایی کنار دریاچه Ebinur، زمین‌های شنی اطراف Alexa League، و علفزارهای بیابانی میانی. پروفایل متابولیک سه اکوتیپ C. desertica نیز نشان داد که 2'-acetylakteosid را می توان به عنوان یک نشانگر شیمیایی برای تشخیص سه اکوتیپ استفاده کرد. ما در مورد تنوع کیفیت C. deserticola و مکانیسم تشکیل آن از ابعاد وراثت، متابولیسم و ​​عوامل آب و هوایی بحث کردیم. بنابراین، از دیدگاه خرد، تحلیل شبکه همبستگی

فراوانی میکروبیوم،PhGsمحتویات و عوامل اکولوژیکی برای روشن کردن ویژگی جامعه میکروبی خاک از سه اکوتیپ انجام شد.C. دسرتیکولاو ارتباط آنها با تنوع کیفیت.

اب. علاوه بر این، Bacilllalescan محصولات متابولیکی غنی را برای سنتز انواع اسیدهای آلی، آنزیم‌ها، فعالیت‌های فیزیولوژیکی و سایر مواد و همچنین انواع مواد مغذی دیگر تولید می‌کند که به راحتی می‌توان از آنها استفاده کرد. خصوصیات زیست محیطی مشترک سه اکوتیپ از C. دسرتیکولاخشکسالی و بیابان زایی خاک است. خاک اطراف دریاچه ابینور نیز با تنش شوری- قلیایی همراه است. این ممکن است دلیلی باشد که جوامع میکروبی خاک هسته سه اکوتیپ دارای ویژگی‌های خاصی از جمله خشکی، تحمل به نمک، مقاومت به قلیایی و مقاومت به تنش هستند.

سیستانچعصاره می تواند مقاومت کندتابش - تشعشع

عوامل میکروبی موثر بر تنوع PhGs در سه اکوتیپ C. deserticola.شکل S3 یک نمودار جعبه ای از محتوای PhG در سه اکوتیپ C. deserticola را نشان می دهد. شکل نشان می دهد که محتوای 2'-استیلاکتئوزید در زمین های شور-قلیایی بیشتر از زمین های مرتع و ماسه ای است که با نتایج قبلی مطابقت دارد. تجزیه و تحلیل اضافی و نتایج شبکه ارتباط نشان می دهد که Oceanospirillales به طور قابل توجهی با 2'-acetylakteosid همبستگی مثبت دارد. Oceanospirillales، بالاترین نشانگر زیستی از نظر امتیاز LDA در زمین های شور-قلیایی، به طور خاص غنی شده اند. این باکتری ها از نظر متابولیک و مورفولوژی متنوع هستند، برخی از آنها می توانند در حضور اکسیژن رشد کنند در حالی که برخی دیگر به محیط بی هوازی نیاز دارند. Oceanospirillales دسته ای از پروتئوباکتری ها هستند که از دو خانواده تشکیل شده است. اسپیریلوم دریایی اغلب یک همزیستی درونی کرم های استخوان خوار (Osedax)35 است. اکثر Oceanospirillales ترجیح می دهند یا به غلظت نمک بالا برای رشد نیاز دارند. Oceanospirillales با وجود رشد در سوله های متنوع، انرژی را از تجزیه محصولات ارگانیک مختلف به دست می آورد. بنابراین، شوری و قلیایی بودن بالا از دلایل اصلی غنی‌سازی Oceanospirillales در خاک شور-قلیایی زمین است. این نتیجه به شدت نشان می دهد که بالاترین محتوای 2'-acetylakteosid در نمک قلیایی مربوط به غنی سازی Oceanospirillales است. با این حال، رابطه تنظیمی بین Oceanospirillales و 2'-acetylakteosid هنوز خالی است و تحقیقات بیشتری مورد نیاز است.

محتویات کلی هفت PhG در علفزار بالاترین مقدار است که در میان آنها اکیناکوزید PhGهای غالب است. Echinacoside به طور قابل توجهی با Sphingomonadales، که دنباله ای در آلفا پروتئوس است و خانواده Erythrobacteraceae و Sphingomonadaceae را تشکیل می دهد، همبستگی مثبت دارد. هر دو خانواده در طبیعت، به ویژه در خاک، اقیانوس ها و آب شیرین مشترک هستند. Sphingomonadales دارای ظرفیت متابولیکی گسترده ای برای ترکیبات معطر است و برخی از سویه ها می توانند بیوپلیمرهای ارزشمند خارج سلولی را سنتز کنند. همه اعضای قبلی شناخته شده از کلاس Sphingomonas هوازی و از نظر شیمیایی آلی هستند. تنها استثنا، تخمیر اتانول بی هوازی اختیاری است که برای تولید خمیر نوشیدنی تخمیر شده استفاده می شود. گونه‌های خاصی از جنس رودوباکتر، پورفیرین و استافیلوکوکوس اورئوس، و همچنین گونه‌های خاصی از جنس Sphingomonas، دارای کلروفیل a هستند و در نتیجه نور ارگانوتروف (انرژی تولید شده از طریق فتوسنتز) اختیاری هستند. بهترین کیفیت C. deserticola در علفزار ممکن است به دلیل تنوع جامعه میکروبی غنی و عملکردهای مرتبط با متابولیک نشانگر زیستی (Sphingomonadales) باشد. این یافته بینش جدیدی را در مورد مطالعه در مورد تنوع کیفیت C. deserticola در اکوتیپ های مختلف ارائه می دهد.

پیش بینی پروفایل عملکرد متابولیک میکروبیوم خاک از سه اکوتیپ C. deserticola.پروفایل های عملکرد متابولیکی (شکل 6 و فایل S1) میکروبیوم های خاک C. deserticola در سه اکوتیپ برای اولین بار در این مطالعه نشان داده شد. از نظر متابولیسم، متابولیسم کربوهیدرات (متابولیسم نشاسته و ساکارز، ko00500، متابولیسم قند آمینه و قند نوکلئوتید، ko00520) و متابولیسم اسیدهای آمینه (متابولیسم آرژنین و پرولین، ko00330؛ متابولیسم گلیسین، سرین و ترئونین، متابولیسم غنی از ko00260) بسیار بالا هستند. میکروبیوم ها متابولیسم کربوهیدرات ها مسئول تشکیل، تجزیه و تبدیل کربوهیدرات ها در بدن است. کربوهیدرات ها اساس بسیاری از مسیرهای متابولیکی مهم هستند. کربوهیدرات هایی مانند گلوکز بخشی از مسیرهای متابولیکی متعدد در گونه ها هستند. کربوهیدرات ها توسط گیاهان از جو از طریق فتوسنتز سنتز می شوند و می توانند به عنوان بستری برای تنفس سلولی استفاده شوند. گیاهان و میکروارگانیسم ها آمونیاک، نمک آمونیوم، نیتریت، نیترات و سایر نیتروژن های معدنی را از محیط جذب می کنند تا پروتئین ها و مواد حاوی نیتروژن را سنتز کنند. برخی از میکروب ها می توانند N2 از هوا را به نیتروژن آمونیاکی برای سنتز اسیدهای آمینه تبدیل کنند. عملکرد متابولیک میکروبیوم های خاک در متابولیسم اولیه غنی شد. این غنی‌سازی نشان می‌دهد که میکروبیوم‌ها می‌توانند تغذیه گیاهان را تامین کنند و رشد آنها را تحت تنش‌های خشکی و دیگر تقویت کنند.

پروفایل های تابع متابولیک همچنین نشان داد که در پردازش اطلاعات محیطی، حمل و نقل غشایی (انتقال دهنده های ABC، ko02010) و انتقال سیگنال (سیستم دو جزئی، ko02020) در میکروبیوم ها بسیار غنی هستند. حمل و نقل غشایی مجموعه ای از مکانیسم هایی است که عبور املاح مانند یون ها و مولکول های کوچک را از طریق یک بیوفیلم، که یک لایه دولایه از لیپیدها در پروتئین ها است، تنظیم می کند. تنظیم غشاهای متقاطع به نفوذپذیری غشاهای انتخابی نسبت داده می شود، ویژگی بیوفیلم ها که جداسازی مواد با خواص شیمیایی متفاوت را امکان پذیر می کند. به عبارت دیگر، این غشاها ممکن است نسبت به برخی از مواد نفوذپذیر باشند اما برای برخی دیگر نه. در میان این غشاها، مسیر انتقال دهنده ABC در میکروبیوم های خاک بسیار غنی شده بود. انتقال دهنده های ATP-binding box (ABC) به طور جهانی در میکروارگانیسم هایی مانند باکتری ها وجود دارند و یکی از بزرگترین خانواده های پروتئینی هستند که امروزه شناخته شده اند. این ناقل ها هیدرولیز ATP را برای شرکت در انتقال فعال سوبستراهای مختلف مانند یون ها، پپتیدها، لیپیدها، داروها، قندها، پروتئین ها و استرول ها متصل می کنند. ساختار انتقال دهنده های ABC در پروکاریوت ها معمولاً از سه قسمت تشکیل شده است. به طور کلی، دو پروتئین غشایی دست نخورده هر کدام دارای شش قطعه گذرنده هستند: دو پروتئین محیطی که ATP را متصل و هیدرولیز می کنند، و یک سوبسترای محیطی (یا لیپوپروتئین) یک پروتئین اتصال. همانطور که در ژنوم بسیاری از باکتری ها و باستانی ها مشاهده شد، بسیاری از ژن های این سه جزء اپرون ها را تشکیل می دهند. خشکی، شوری و تنش قلیایی عملکرد حمل و نقل غشایی، به ویژه بهبود عملکرد انتقال فعال میکروبیوم‌های خاک را ارتقا دادند.

انتقال سیگنال فرآیندی است که در آن یک سیگنال شیمیایی یا فیزیکی از طریق یک سلول به صورت مجموعه ای از رویدادهای مولکولی منتقل می شود. رایج ترین آنها فسفوریلاسیون پروتئین کاتالیز شده با پروتئین کیناز است. سیستم دو جزئی یک مسیر سیگنالینگ است که بسیاری از خصوصیات باکتریایی مانند سمیت، بیماری زایی، همزیستی، تحرک، جذب مواد مغذی، تولید متابولیت های ثانویه، تنظیم متابولیک و تقسیم سلولی را تنظیم می کند. این سیستم ها فرآیندهای فیزیولوژیکی را بر اساس پارامترهای محیطی یا سلولی تنظیم می کنند و آنها را قادر می سازند تا با شرایط متغیر سازگار شوند. انتقال سیگنال میکروبیوم های خاک با خشکسالی یا تنش شوری-قلیایی ترویج شد.

سیستانچاستخراج کنآنتی اکسیدان

نتیجه

این مطالعه اولین مطالعه ای است که میکروبیوم های خاک سه اکوتیپ C. deserticola را ارائه می کند. نتایج زیر به دست می آید: (1) جامعه میکروبی خاک در مرتع فراوان ترین در بین سه زیستگاه است. (2) نشانگرهای زیستی سه اکوتیپ نیز مشخص شد: Oceanospirillales (زمین شور-قلیایی)، Sphingomonadales (علفزار)، و Propionibacteriales (زمین شنی). (3) تجزیه و تحلیل میکروبیوم هسته نشان داد که جوامع میکروبی خاک C. deserticola عمدتاً دارای خشکی، تحمل به نمک، مقاومت قلیایی، و مقاومت در برابر استرس، مانند میکروکوکال‌ها و باسیل‌ها هستند. (4) تجزیه و تحلیل همبستگی نشان داد که 2'-acetylacteoside با Oceanospirillales و اکیناکوزید به طور قابل توجهی با Sphingomonadales همبستگی مثبت دارد. (5) Tax4Fun پیش بینی می کند که پروفایل های عملکرد متابولیکی سه اکوتیپ از میکروبیوم خاک در متابولیسم و ​​پردازش اطلاعات محیطی غنی شده است.

منابع

1. Zheng, S., Jiang, X., Wu, L., Wang, Z. & Huang, L. تمایز شیمیایی و ژنتیکی cistanches گیاهی بر اساس UPLC-QTOF/MS و بارکد DNA. Plus One 9, e98061 (2014).

2. Li، Z. و همکاران. مدل سازی اکولوژیکی Cistanche deserticola YC Ma در آلکسا، چین. گزارش های علمی 9، 13134، https://doi.org/10.1038/ s{5}} (2019).

3. جوزف، ای و همکاران. ساختار، تنوع، و مونتاژ میکروبیوم های مرتبط با ریشه برنج. مجموعه مقالات آکادمی ملی علوم ایالات متحده آمریکا 112، E911 (2015).

4. Jansson، JK & Hofmockel، KS میکروبیوم خاک، و تغییرات آب و هوا. بررسی طبیعت میکروبیولوژی، https://doi.org/10.1038/ s41579-019-0265-7 (2019).

5. وانگ، ایکس و همکاران. مقایسه نمایه‌های شیمیایی و فعالیت‌های آنتی‌اکسیدانی بخش‌های مختلف صحرای سیستانش کشت شده با استفاده از کروماتوگرافی مایع با عملکرد فوق‌العاده- طیف‌سنجی جرمی زمان پرواز چهارقطبی و پیکریل هیدرازیل 1،1-دیفنیل-2-. Molecules 22, 2011 (2017).

6. یانگ، ال و همکاران. اثرات مفید فراکسیون گلیکوزید فنیل اتانوئید کل جدا شده از گیاه سیستانش دسرتیکولا بر ریزساختار استخوان در موش های صحرایی تخمدان برداری شده. داروی اکسیداتیو و طول عمر سلولی 2019، 2370862، https://doi. org/10.1155/2019/2370862 (2019).

7. لیو، دبلیو و همکاران. از (1) استراتژی متابولومیک هدفمند مبتنی بر H NMR تا استراتژی متابولومیک هدفمند مبتنی بر LC-MS برای مقایسه عمیق بابونه در بین چهار گونه Cistanche. مجله تجزیه و تحلیل دارویی و زیست پزشکی 162، 16-27، https://doi.org/10.1016/j. jpba.2018.09.013 (2019).

8. چن، اچ و همکاران. میکروبیوم هسته گیاه دارویی بذر مریم گلی: مخزن غنی از میکروب های مفید برای متابولیسم ثانویه؟ مجله بین المللی علوم مولکولی 19، 672 (2018).

9. Sonnenburg، JL & Backhed، F. تداخلات رژیم غذایی و میکروبیوتا به عنوان تعدیل کننده متابولیسم انسانی. طبیعت 535، 56–64، https://doi. org/10.1038/nature18846 (2016).

10. Ju, F. & Zhang, T. 16S rRNA ژن توالی یابی داده کاوی تنوع میکروبی و تعاملات. میکروبیولوژی کاربردی و بیوتکنولوژی 99، 4119-4129 (2015).

11. Cui, J.-L., Vijayakumar, V. & Zhang, G. پارتیشن بندی مجموعه های اندوفیت قارچی در گیاه ریشه انگلی Cynomorium songaricum و میزبان آن Nitraria tangutorum. مرزها در میکروبیولوژی 9، 666 (2018).

12. Fan, P., Liu, P., Song, P., Chen, X. & Ma, X. محدودیت متوسط ​​پروتئین در رژیم غذایی ترکیب میکروبیوتای روده را تغییر می دهد و عملکرد سد روده را در مدل خوک بالغ بهبود می بخشد. گزارش های علمی 7, 43412 (2017).

13. Munyaka، PM et al. درمان آنتی بیوتیکی قبل از تولد Mo1774 حساسیت فرزندان به کولیت تجربی را افزایش می دهد: نقش میکروبیوتای روده. Plus One 10, e0142536 (2015).

14. ژائو، ی و همکاران. تأثیر شدت اختلاط بر عملکرد و دینامیک میکروبی یک راکتور عمودی منفرد که فازهای اسید زایی و متانوژنیک را در هضم زیست توده لیگنوسلولزی ادغام می کند. فناوری منابع زیستی 238، 542-551 (2017).

15. کول، جی آر و همکاران. پروژه پایگاه داده ریبوزومی: ترازهای بهبود یافته و ابزارهای جدید برای تجزیه و تحلیل rRNA (2009).

16. Edgar, RC UPARSE: توالی های OTU بسیار دقیق از آمپلیکون میکروبی خوانده می شود. Nature Methods 10، 996 (2013).

17. یو، دبلیو و همکاران. مقایسه سطوح تنوع باکتریایی در آب های شیرین، تالاب های جزر و مدی و رسوبات دریایی با استفاده از میلیون ها تگ Illumina. میکروبیولوژی کاربردی و محیطی 78، 8264 (2012).

18. جیانگ، XT و همکاران. توالی یابی Illumina برچسب 16S rRNA تغییرات فضایی جوامع باکتریایی را در یک تالاب حرا نشان داد. اکولوژی میکروبی 66، 96-104 (2013).

19. Sanner، MF Python: یک زبان برنامه نویسی برای یکپارچه سازی و توسعه نرم افزار. مجله گرافیک مولکولی و مدلسازی

17, 57–61 (1999).

20. کاپوراسو، جی جی و همکاران. QIIME امکان تجزیه و تحلیل داده های توالی یابی جامعه با توان بالا را فراهم می کند. Nat Methods 7، 335-336، https://doi. org/10.1038/nmeth.f.303 (2010).

21. Chong, J., Liu, P., Zhou, G. & Xia, J. Using MicrobiomeAnalyst برای آماری جامع، عملکردی و متاآنالیز داده های میکروبیوم. پروتکل های طبیعت، 1-23 (2020).

22. Dhariwal، A. و همکاران. MicrobiomeAnalyst: ابزاری مبتنی بر وب برای تجزیه و تحلیل جامع آماری، بصری و متاآنالیز داده های میکروبیوم. تحقیقات اسیدهای نوکلئیک 45، W180-W188 (2017).

23. Šmilauer, P. & Lepš, J. تجزیه و تحلیل چند متغیره داده های اکولوژیکی با استفاده از CANOCO 5. (انتشارات دانشگاه کمبریج (2014).

24. شانون، پی و همکاران. Cytoscape: یک محیط نرم افزاری برای مدل های یکپارچه شبکه های تعامل بیومولکولی. تحقیقات ژنوم 13، 2498-2504 (2003).

25. Asshauer، KP، Wemheuer، B.، Daniel، R. & Meinicke، P. Tax4Fun: پیش‌بینی مشخصات عملکردی از داده‌های متاژنومی 16S rRNA. بیوانفورماتیک (آکسفورد، انگلستان) 31، 2882–2884، https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv287 (2015).

26. کو، اچ و همکاران. مقایسه دو ابزار بیوانفورماتیک مورد استفاده برای توصیف تنوع میکروبی و ویژگی‌های عملکردی پیش‌بینی تشک‌های میکروبی از دریاچه اوبرسی، قطب جنوب. مجله روش های میکروبیولوژیکی 140، 15-22 (2017).

27. Huang, L., Zheng, S., Wu, L., Jiang, X. & Chen, S. Ecotypes of Cistanche deserticola بر اساس ترکیب شیمیایی و صفات مولکولی. Scientia Sinica Vitae 44, 318-328 (2014).

28. Gabriele, B. & Kornelia, S. گونه های گیاهی و نوع خاک ساختار و عملکرد جوامع میکروبی را در ریزوسفر شکل می دهند. Fems Microbiology Ecology 68، 1-13 (2010).

29. Parte، AC LPSN-فهرست نام‌های پروکاریوتی با جایگاه در نامگذاری. تحقیقات اسیدهای نوکلئیک 42، 613-616 (2014).

30. Pirog, T., Grinberg, T. & Malashenko, YR عملکردهای محافظتی اگزوپلی ساکاریدهای تولید شده توسط یک Acinetobacter sp. میکروبیولوژی (نیویورک، نیویورک) 66، 279-283 (1997).

31. لیو، Y.-H. و همکاران تنوع، توزیع جامعه، و فعالیت های ترویج رشد اندوفیت های مرتبط با هالوفیت Lycium ruthenicum Murr. 3 Biotech 9, 144 (2019).

32. Staley, Bryant, Pfennig, Holt & JG Bergey's systematic bacteriology - جلد 4. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 38, 89-100 (1989).

33. Pasqua, RD et al. تأثیر منابع مختلف لیگنوسلولز بر بیان ژن اندو-1،4- -و فعالیت آنزیمی Bacillus amyloliquefaciens B31C. منابع زیستی 9 (2014).

34. Pot, B. & Gillis, M. Oceanospillum. (2015).

35. Euzeby, JP فهرست نام‌های باکتری با نام‌گذاری: پوشه‌ای که در اینترنت موجود است. مجله بین المللی سیستماتیک باکتریولوژی 47، 590-592، https://doi.org/10.1099/00207713-47-2-590 (1997).

36. Balkwill، DL، Fredrickson، JK & Romine، MF Sphingomonas و Related Genera. Prokaryotes 7, 605-629 (2003).

37. Takeuchi, M., Hamana, K. & Hiraishi, A. پیشنهاد جنس Sphingomonas sensu stricto و سه جنس جدید Sphingobium, Novosphingobium و Sphingopyxis بر اساس آنالیزهای فیلوژنتیک و کموتاکسونومیک. مجله بین المللی میکروبیولوژی سیستماتیک و تکاملی 51، 1405-1417 (2001).

38. Saori, S. & Akira, H. Novosphingobium naphthalenivorans sp. نوامبر، یک باکتری تجزیه کننده نفتالین جدا شده از محیط های آلوده به دیوکسین پلی کلره. مجله میکروبیولوژی عمومی و کاربردی 53، 221-228 (2007).

39. Alánt, O., Pulay, I., Esztergályos, J. & Bodnár, A. اثر جراحی بر متابولیسم کربوهیدرات. Acta Chirurgica Academiae Scientiarum Hungaricae 16, 307 (1975).

40. خاکستری، هضم و جذب کربوهیدرات GM. Encyclopedia of Gastroenterology 58, 275-278 (2004).

41. Coon, MJ & Robinson, WG Amino Acid Metabolism. (2003).

42. Purves، WK، Orians، G.، Heller، C. & Sadava، D. Vida، LaCiencia de la Biología. نسخه 8. پانامریکانا (2009).

43. Schneider، E. & Hunke، S. ATP-binding-cassette system (ABC): جنبه های عملکردی و ساختاری زیر واحدها/دامنه های هیدرولیزکننده ATP. Fems Microbiology Reviews 22, 1-20 (1998).

44. Kleerebezem، M.، Quadri، LE، Kuipers، OP & Vos، WM De. سنجش حد نصاب توسط فرمون های پپتیدی و سیستم های انتقال سیگنال دو جزئی در باکتری های گرم مثبت میکروبیولوژی مولکولی 24، 895-904 (2010).