تغییرات در فرآیندهای کاتابولیک ترجمه پروتئین و کربوکسیلیک اسید در بیماری کلیوی دیابتی Ⅱ

3. نتایج

3.1. سوژه های انسانی

بافت کلیهنمونه از 18 نفر با DKD و 9 موضوع مرجع بدونDKDبه دست آوردند و مورد مطالعه قرار گرفتند (جدول 1). میانگین سنی در هنگام اکتساب بافت 55.{2}} سال در افراد مبتلا به DKD و 50.0 در افراد نفرکتومی مرجع بود. افراد مبتلا به DKD 61.1٪ زن و 27.8٪ سیاه پوست بودند. اکثر افراد DKD گلومرولواسکلروز ندولار داشتند و حدود نیمی از آنها بیش از 80 درصد از بین رفتن فرآیندهای پاهای پودوسیتی داشتند. پروتئینوری محدوده نفروتیک در 55.6٪ از افراد DKD مشاهده شد. eGFR پایه 26.2 ± 63.2 میلی لیتر در دقیقه بود. آزمودنی ها به طور متوسط ​​14.5 میلی لیتر در دقیقه در سال eGFR را در طول مدت پیگیری که به طور متوسط ​​47.7 ماه بود از دست دادند. به عنوان یک گروه مقایسه کننده مولکولی، 9 نمونه نفرکتومی مرجع به دست آمد. این نمونه ها توسط یک نابینا ارزیابی شدندآسیب شناس کلیه(CP) و نشان داده نشدشواهد بافت شناسیخاص بهکلیه دیابتیبیماری؛ با این حال، بالینی وداده های جمعیتیمانند نژاد، پروتئینوری و eGFR در دسترس نبودند.

گیاهان جدید برای کلیه های دیابتیبیماری

3.2. بیان ژن افتراقی و آنالیز مسیر در گلومرول انسان دیابتی و توبول پروگزیمال

بیان ژن افتراقی و تجزیه و تحلیل مسیر در گروه DKD و مرجع انجام شد. ژن‌های بیان‌شده متفاوت (DEGs) در گلومرول‌های ریز جدا شده با لیزر و توبول‌های پروگزیمال هر دو گروه شناسایی شدند (جدول تکمیلی S1؛ https://doi.org/1{12}}.6084/m9.figshare.14450190.v1، به شماره 23 مشاهده شد. ژانویه 2022). نشانگرهای گلومرولی شناخته شده در DKD، از جمله نفرین (NPHS1, 3- برابر کاهش، p=1.0 × 10-4 ) و فسفولیپاز C اپسیلون 1 (PLCE1, 2) پایین آمدند. }بار کاهش، p=3.3 × 10−4). به همین ترتیب، نشانگرهای لوله پروگزیمال شامل کوفاکتور خروجی سدیم-هیدروژن 3 (PDZK1، 4.{27}}کاهش برابر، p=1.9 × 10-5) و هم انتقال دهنده سدیم-فسفات (SLC34A1، 3. 2-کاهش برابر، p=8.1 × 10-4) در DKD کاهش یافت که احتمالاً منعکس کننده آسیب مزمن است.

ما غنی‌سازی مسیر را از طریق آنالیز شبکه رونویسی در گلومرول انسانی و لوله پروگزیمال DKD و نمونه‌های مرجع بررسی کردیم. این تجزیه و تحلیل، میزان بیان دیفرانسیل، جهت اثر، سطح اهمیت، و نزدیکی ژن‌های کدکننده پروتئین را که در امتداد محور x بر اساس برهمکنش‌های شناخته شده پروتئین-پروتئین مرتب شده‌اند، در بر می‌گیرد. غنی‌ترین مسیرهای گلومرول شامل انتقال سیگنال با واسطه GTPase (p=4.3 × 10-6) و اتصال لیگاند با گیرنده جفت شده با پروتئین G (GPCR) (p=8.1 × 10-) بود. 6). در لوله پروگزیمال، مسیرهای بالایی گیرنده‌های رودوپسین مانند (p=4.1 × 10-6) و سیگنال‌دهی بویایی (p=1.9 × 10-4) بودند. به طور جالبی، مسیر ریبوزوم (ترجمه) هم در گلومرول و هم در لوله پروگزیمال غنی شد (شکل 1). فهرست کاملی از مسیرهای تنظیم شده متفاوت در جدول تکمیلی S2 آمده است. (https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14450196.v1، مشاهده شده در 23 ژانویه 2022)

برای تعیین جهت اثر برای مسیرهای ترجمه غنی‌شده در نمونه‌های DKD، شماتیک نمای مسیر مسیر معادل KEGG، ریبوزوم hsa03010، برای هر دو گلومرول و توبول پروگزیمال تهیه شد. ژن‌های موجود در مسیرهای ترجمه و متابولیسم اسیدهای آمینه و مشتقات GO با مسیر KEGG ریبوزوم با همپوشانی 130 و 87 ژن از 186 ژن، به ترتیب همسو هستند. بیان کلی ژن های ریبوزومی هم در گلومرول و هم در لوله های پروگزیمال آزمودنی های DKD تنظیم شده بود (شکل 2).

3.3. ترجمه در کلیه موش دیابتی تغییر کرده است

برای درک بهتر اهمیت غنی‌سازی مسیر در نمونه‌های بیوپسی DKD انسانی، بیان دیفرانسیل را در موش db در مقایسه با سویه کنترل پس‌زمینه با استفاده از توالی‌یابی RNA حجیم جویا شدیم. تجزیه و تحلیل مسیر (در سن 9 هفتگی) بین موش های دیابتی در مقابل سویه کنترل نشان داد که مسیر غنی شده برتر سیگنالینگ cGMP-پروتئین کیناز G بود (p=2).0 × 10-- 6) (شکل 3A). در میان مسیرهای غنی شده، بیوژنز ریبوزوم مرتبط با ترجمه بود (047.0=0)، که با مجموعه داده غنی‌سازی مسیر DKD انسانی "همپوشانی داشت". برای بررسی مستقیم پیامد عملکردی افزایش رونویسی و بیان پروتئین‌های تنظیم‌کننده ترجمه، ما پروفایل پلی ریبوزومی را روی کلیه‌ها از موش‌های db و پس‌زمینه کنترل انجام دادیم. این سنجش سطح عمومی ترجمه را بر اساس اشغال mRNA توسط ریبوزوم ها کمیت می کند. پروفایل پلی ریبوزومی نشان داد که نسبت سطح زیر منحنی پلی زوم به تک‌زوم در موش‌های دیابتی (9.76) در مقایسه با موش‌های کنترل (7.73، p <0.05 برای اختلاف نسبت‌ها) افزایش یافته است، که با افزایش ترجمه کلی در موش‌های دیابتی سازگار است.کلیه در دیابت(شکل 3B).

خدمات پشتیبانی Wecistanche

ایمیل:wallence.suen@wecistanche.com

واتساپ/تلفن:+86 15292862950